Educado numa rígida doutrina calvinista, São João com treze anos foi enviado para a França e Alemanha por causa dos estudos. Ao se deparar com o testemunho de vida dos Católicos iniciou uma crise espiritual, que se findou na sua conversão ao Catolicismo que implicava na época a ruptura com a família e a perda de seu sustento.

Mesmo com a certeza de ser perseguido em sua Pátria São João abraçou a Igreja Católica, pois de grande honestidade intelectual decidiu-se radicalmente por reconhecer que caminhava para a verdade, vontade e convite de Deus. Mais tarde entrou na Companhia de Jesus, onde chamava a atenção pela sua serenidade e alegria de viver. Chegou ao sacerdócio, o qual pôde também exercer na Escócia, de modo clandestino devido a perseguição, mas de forma corajosa e santa, até ser preso por professar sua fé ao Cristo, a verdade e amor ao Papa, por isso foi humilhado, condenado e martirizado em 1615.